参画プロジェクト

教育関連

筑波大学ライフイノベーション学位プログラム
研究分野:バイオインフォマティクス・情報統合(桝屋啓志:筑波大学グローバル教育院 教授(協働大学院))
https://tlsi.tsukuba.ac.jp/education1.html

外部資金等

科学研究費 基盤研究(C)(一般)
マウスの個体異常を高精度に検出可能なワークフローの開発(代表・田中)
https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-21K05993/

ムーンショット型農林水産研究開発事業
食料供給の拡大と地球環境保全を両立する食料生産システム
土壌微生物叢アトラスに基づいた環境制御による循環型協生農業プラットフォーム構築(栽培マネジメント)
https://www.naro.go.jp/laboratory/brain/moon_shot/index.html

科学研究費 挑戦的研究(萌芽)
生体内分子イベントを指標とした老化要因物質の高速発光判定基盤技術の創成 (分担)
https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-20K21851/

科学研究費 基盤研究(C)(一般)
エネルギーランドスケープを利用した生物群集大規模変動の前兆検知(代表・鈴木)
https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-20K06820/

科学研究費 基盤研究(B)(一般)
広域環境変動下での生物群集レジリエンス評価・予測に関する研究(分担)
https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-20H03010/

理研オープンライフサイエンスプラットフォーム
分子から個体レベルに及ぶ多階層かつ異なる測定法によるマルチモーダルなデータを集積・統合し、データ主導的に細胞や個体の状態の精緻な予測や操作を可能にする、オープンビッグデータ時代の解析基盤(プラットフォーム)を目指します
https://olsp.riken.jp

戦略的イノベーション創造プログラム(スマートバイオ産業・農業基盤技術)
バイオ・デジタル融合イノベーションを創出する研究開発基盤の構築 (1)生物情報ビッグデータ・バイオリソースの民間利用の促進(分担)

その他連携プロジェクト

理研メタデータベース
http://metadb.riken.jp

Inernatioal Mouse Phenotyping Consortium (IMPC)
http://www.mousephenotype.org

Asian Mouse Mutagenesis Resource Association (AMMRA)
http://ammra.info/

バイオサイエンスデータベースセンター(NBDC)
https://biosciencedbc.jp

SPARQLthon
http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/SPARQLthon

SPARQL Builder Project / LOD Surfer Project
http://www.sparqlbuilder.org
https://github.com/dbcls/bh17/wiki/LOD-Surfer

オントロジー構築環境「法造」
http://www.hozo.jp/index_jp.html

外部資金等(終了分)

情報・システム研究機構 ROIS-DS-JOINT2020(RP_一般共同研究)(2020)
希少・難治性疾患のゲノム医療推進に資する情報基盤の高度化とその応用(代表・櫛田)

ナショナルバイオリソースプロジェクト ゲノム情報等整備プログラム(2020)
日本産疾患モデルマウス系統の長鎖解読によるゲノム情報整備(代表・高田)
https://nbrp.jp

科学研究費 基盤研究(B)(海外学術調査)(2019-2020)
ミャンマー産住家性ネズミ類の系統解析と自然史の統合的理解(分担)
https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-17H04604/

国立研究開発法人日本医療研究開発機構・臨床ゲノム情報統合データベース整備事業(2016-2020)
真に個別患者の診療に役立ち領域横断的に高い拡張性を有する変異・多型情報データベースの創成(分担)
https://www.amed.go.jp/program/list/04/01/006.html

文部科学省科学研究費補助金新学術領域研究・「個性」創発脳(2016-2020)
計画研究:「個性」を発見するマーカレス表現型記録・マイニングシステムの開発(分担)
http://www.koseisouhatsu.jp

科学研究費 基盤研究(B)(一般)(2018-2020)
老化現象の解明に資する、オープンデータを体系的に利用した知識推論基盤の構築(代表・桝屋)
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18H03298/

科学研究費 挑戦的萌芽研究(2016-2018)
表現形質の異常を高精度に検出可能な手法の開発(代表・田中)
https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-16K14600/

北海道大学COI「食と健康の達人」拠点(2018)
細菌叢変動予測の実現を目指したAI要素技術の開発に向けた調査研究(分担)
https://www.fmi.hokudai.ac.jp/coi/



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