- 転写制御エレメントの統合データベースfanta.bioが正式リリースされました。(2024.2.27)
- BRC Young Scientists Networking Symposium 2024 参加者募集中!(2023.12.22)
- 第46回分子生物学会年会にてポスター発表します。(2023.12.1)
- 山縣研究員が人工知能学会全国大会優秀賞を受賞しました。(2023.11.8)
- 研究員(無期雇用職)を募集中(2023.10.6)
- 特別研究員または開発研究員を募集中(2023.9.28)
外部資金プロジェクト
- 科学技術振興機構 戦略的創造研究推進事業(CREST)
- 戦略目標:『バイオDX』による科学的発見の追究
研究領域:データ駆動・AI駆動を中心としたデジタルトランスフォーメーションによる生命科学研究の革新
多種生命システムの安定化と機能最適化を実現する融合科学の創生(分担)
https://www.jst.go.jp/kisoken/crest/application/2023/230919/230919crest.pdf - 情報・システム研究機構 ROIS-DS-JOINT(一般共同研究)(2023)
- 「疾患モデルマウス系統のゲノムアセンブル情報高度化とゲノムアノテーション」(代表・高田)
「哺乳類表現型語彙の日本語整備とオントロジーアライメントおよびそれを活用したバイオリソース検索システムの構築」(代表・櫛田)
https://ds.rois.ac.jp/article/2023_rois-ds-joint_result - 日本医療研究開発機構「再生・細胞医療・遺伝子治療実現加速化プログラム(疾患特異的iPS細胞を用いた病態解明・創薬研究課題)」
- 疾患特異的iPS細胞の樹立・特性解析・加工の高度化・効率化・情報公開(分担)
- 統合化推進プログラム
- 細胞ごとの多様な活性やゲノム変異・多型との関連を探索できるシスエレメント・データベースの開発(分担)
https://biosciencedbc.jp/news/20220401-03.html - 科学研究費 基盤研究(C)(一般)
- 実験動物マウスの系統特異的な可動遺伝因子の挙動と疾患発症の連関解析(代表・高田)
https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-22K06061/ - 科学研究費 基盤研究(B)(一般)
- 検出誤差に対して頑健な環境DNAメタバーコーディングの進展(分担)
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23H02240/ - 理研オープンライフサイエンスプラットフォーム
- 分子から個体レベルに及ぶ多階層かつ異なる測定法によるマルチモーダルなデータを集積・統合し、データ主導的に細胞や個体の状態の精緻な予測や操作を可能にする、オープンビッグデータ時代の解析基盤(プラットフォーム)を目指します
https://olsp.riken.jp
その他連携プロジェクト
- Mammalian Phenotype Ontology (MP) 日本語訳プロジェクト(DBCLS)
- https://github.com/dbcls/MP_Japanse/tree/main
- 理研メタデータベース
- http://metadb.riken.jp
- Internatioal Mouse Phenotyping Consortium (IMPC)
- http://www.mousephenotype.org
- Asian Mouse Mutagenesis Resource Association (AMMRA)
- http://ammra.info/
- バイオサイエンスデータベースセンター(NBDC)
- https://biosciencedbc.jp
- SPARQLthon
- http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/SPARQLthon
- SPARQL Builder Project / LOD Surfer Project
- http://www.sparqlbuilder.org
https://github.com/dbcls/bh17/wiki/LOD-Surfer - オントロジー構築環境「法造」
- http://www.hozo.jp/index_jp.html