お知らせ
- 高田豊行開発研究員の取り組みが、「RIKEN People」で紹介されました。（2025.6.18）
- テクニカルスタッフⅡ募集のお知らせ（終了しました。）（2025.6.4）
- 開発研究員募集のお知らせ（終了しました。）（2025.6.4）
- 第98回日本細菌学会総会にて、高野開発研究員が発表を行います。（2025.5.26）
- 櫛田達矢研究員が執筆した論文が科学雑誌に掲載されました。（2025.5.19）
外部資金プロジェクト
- 科学技術振興機構 戦略的創造研究推進事業（ACT-X）(2024～2026)
- 代謝モデルを基軸とする頑健な生態系の網羅的探索技術の開発 （代表・高野）
https://www.jst.go.jp/kisoken/act-x/application/2024/240917/240917act-x.pdf - 情報・システム研究機構 ROIS-DS-JOINT（一般共同研究）(2024)
- 「疾患モデルマウス系統のゲノムアセンブル情報高度化とゲノムアノテーション」（代表・高田）
「哺乳類表現型語彙の日本語整備とオントロジーアライメントおよびそれを活用したバイオリソース検索システムの構築」（代表・櫛田）
https://ds.rois.ac.jp/article/2024_rois-ds-joint_result - 科学技術振興機構 戦略的創造研究推進事業（CREST）(2023～2028)
- 戦略目標：『バイオＤＸ』による科学的発見の追究
研究領域：データ駆動・ＡＩ駆動を中心としたデジタルトランスフォーメーションによる生命科学研究の革新
多種生命システムの安定化と機能最適化を実現する融合科学の創生（分担・鈴木）
https://www.jst.go.jp/kisoken/crest/application/2023/230919/230919crest.pdf - 日本医療研究開発機構「革新的先端研究開発支援事業ステップタイプ（FORCE）」(2024～2025)
- 「腸内細菌叢由来因子による肝がん微小環境の形成メカニズムの解明と予後予測・予防・治療への応用」（分担・鈴木）
https://www.amed.go.jp/koubo/16/02/1602C_00025.html - 日本医療研究開発機構「次世代治療・診断実現のための創薬基盤技術開発事業（腸内マイクロバイオーム制御による次世代創薬技術の開発）」(2021～2026)
- 「1粒子遺伝子解析に基づいたin vivo膜小胞産生細菌のハイスループット特定技術の開発と生菌製剤応用基盤の構築」（分担・高野）
https://www.amed.go.jp/koubo/11/01/1101C_00012.html - 日本医療研究開発機構「再生・細胞医療・遺伝子治療実現加速化プログラム（疾患特異的iPS細胞を用いた病態解明・創薬研究課題）」（2023～2025）
- 疾患特異的iPS細胞の樹立・特性解析・加工の高度化・効率化・情報公開（代表・桝屋）
https://www.amed.go.jp/koubo/13/01/1301C_00027.htmll - 統合化推進プログラム(2022～2026)
- 細胞ごとの多様な活性やゲノム変異・多型との関連を探索できるシスエレメント・データベースの開発（分担・桝屋）
https://biosciencedbc.jp/news/20220401-03.html - 科学研究費 若手研究
- 遺伝子水平伝播に寄与する細菌膜小胞のカタログ化技術の確立（代表・高野）(2024～2027)
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-24K17823/ - COVID-19重症化リスク低減のためのオントロジーに基づく知識統合とその応用（代表・山縣）(2022～2025)
https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-22K17959/ - 科学研究費 基盤研究（C)（一般）(2022～2025)
- 実験動物マウスの系統特異的な可動遺伝因子の挙動と疾患発症の連関解析（代表・高田）
https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-22K06061/ - 科学研究費 基盤研究（B）（一般）
- シミュレーションデータの深層学習による生態系レジームシフト予兆シグナルの開発（分担・鈴木）(2024～2027)
https://kaken.nii.ac.jp/ja/grant/KAKENHI-PROJECT-24K03127/ - 検出誤差に対して頑健な環境DNAメタバーコーディングの進展（分担・鈴木）(2023～2026)
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-23H02240/
その他連携プロジェクト
- 理研オープンライフサイエンスプラットフォーム
- 分子から個体レベルに及ぶ多階層かつ異なる測定法によるマルチモーダルなデータを集積・統合し、データ主導的に細胞や個体の状態の精緻な予測や操作を可能にする、オープンビッグデータ時代の解析基盤（プラットフォーム）を目指します
https://olsp.riken.jp - INtegrated TRAnscriptional REgulation Data platform (INTRARED)
- https://www.intrared.org
- Mammalian Phenotype Ontology (MP) 日本語訳プロジェクト（DBCLS）
- https://github.com/dbcls/MP_Japanse/tree/main
- 理研メタデータベース
- http://metadb.riken.jp
- Internatioal Mouse Phenotyping Consortium (IMPC)
- http://www.mousephenotype.org
- Asian Mouse Mutagenesis Resource Association (AMMRA)
- http://ammra.info/
- バイオサイエンスデータベースセンター（NBDC）
- https://biosciencedbc.jp
- SPARQLthon
- http://wiki.lifesciencedb.jp/mw/SPARQLthon
- SPARQL Builder Project / LOD Surfer Project
- http://www.sparqlbuilder.org
https://github.com/dbcls/bh17/wiki/LOD-Surfer - オントロジー構築環境「法造」
- http://www.hozo.jp/index_jp.html
